Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5P7

Tdrp, Testis development-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrpQ8C5P7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TdrpQ8C5P7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TdrpQ8C5P7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TdrpQ8C5P7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TdrpQ8C5P7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TdrpQ8C5P7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TdrpQ8C5P7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TdrpQ8C5P7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TdrpQ8C5P7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TdrpQ8C5P7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TdrpQ8C5P7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TdrpQ8C5P7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TdrpQ8C5P7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TdrpQ8C5P7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TdrpQ8C5P7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TdrpQ8C5P7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TdrpQ8C5P7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TdrpQ8C5P7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TdrpQ8C5P7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TdrpQ8C5P7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TdrpQ8C5P7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TdrpQ8C5P7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TdrpQ8C5P7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TdrpQ8C5P7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TdrpQ8C5P7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TdrpQ8C5P7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TdrpQ8C5P7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TdrpQ8C5P7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TdrpQ8C5P7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TdrpQ8C5P7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TdrpQ8C5P7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TdrpQ8C5P7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TdrpQ8C5P7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TdrpQ8C5P7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TdrpQ8C5P7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TdrpQ8C5P7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TdrpQ8C5P7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TdrpQ8C5P7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TdrpQ8C5P7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TdrpQ8C5P7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TdrpQ8C5P7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TdrpQ8C5P7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TdrpQ8C5P7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TdrpQ8C5P7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TdrpQ8C5P7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TdrpQ8C5P7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TdrpQ8C5P7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TdrpQ8C5P7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TdrpQ8C5P7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TdrpQ8C5P7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TdrpQ8C5P7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TdrpQ8C5P7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TdrpQ8C5P7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TdrpQ8C5P7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TdrpQ8C5P7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TdrpQ8C5P7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TdrpQ8C5P7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TdrpQ8C5P7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TdrpQ8C5P7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TdrpQ8C5P7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TdrpQ8C5P7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TdrpQ8C5P7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TdrpQ8C5P7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TdrpQ8C5P7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TdrpQ8C5P7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TdrpQ8C5P7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TdrpQ8C5P7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TdrpQ8C5P7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TdrpQ8C5P7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TdrpQ8C5P7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TdrpQ8C5P7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TdrpQ8C5P7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TdrpQ8C5P7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TdrpQ8C5P7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TdrpQ8C5P7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TdrpQ8C5P7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TdrpQ8C5P7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TdrpQ8C5P7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TdrpQ8C5P7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TdrpQ8C5P7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TdrpQ8C5P7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TdrpQ8C5P7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TdrpQ8C5P7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TdrpQ8C5P7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TdrpQ8C5P7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TdrpQ8C5P7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TdrpQ8C5P7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TdrpQ8C5P7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TdrpQ8C5P7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TdrpQ8C5P7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TdrpQ8C5P7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TdrpQ8C5P7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TdrpQ8C5P7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TdrpQ8C5P7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TdrpQ8C5P7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TdrpQ8C5P7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TdrpQ8C5P7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TdrpQ8C5P7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TdrpQ8C5P7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TdrpQ8C5P7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
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