Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TiparpQ8C1B2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TiparpQ8C1B2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TiparpQ8C1B2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TiparpQ8C1B2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TiparpQ8C1B2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TiparpQ8C1B2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TiparpQ8C1B2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TiparpQ8C1B2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TiparpQ8C1B2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TiparpQ8C1B2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TiparpQ8C1B2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TiparpQ8C1B2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TiparpQ8C1B2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TiparpQ8C1B2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TiparpQ8C1B2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TiparpQ8C1B2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TiparpQ8C1B2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TiparpQ8C1B2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TiparpQ8C1B2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TiparpQ8C1B2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TiparpQ8C1B2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TiparpQ8C1B2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TiparpQ8C1B2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TiparpQ8C1B2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TiparpQ8C1B2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TiparpQ8C1B2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TiparpQ8C1B2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TiparpQ8C1B2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TiparpQ8C1B2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TiparpQ8C1B2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TiparpQ8C1B2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TiparpQ8C1B2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TiparpQ8C1B2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TiparpQ8C1B2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TiparpQ8C1B2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TiparpQ8C1B2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TiparpQ8C1B2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TiparpQ8C1B2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TiparpQ8C1B2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TiparpQ8C1B2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TiparpQ8C1B2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TiparpQ8C1B2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TiparpQ8C1B2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TiparpQ8C1B2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TiparpQ8C1B2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TiparpQ8C1B2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TiparpQ8C1B2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms