Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc44a2Q8BY89 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc44a2Q8BY89 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc44a2Q8BY89 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc44a2Q8BY89 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a2Q8BY89 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a2Q8BY89 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a2Q8BY89 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc44a2Q8BY89 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a2Q8BY89 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc44a2Q8BY89 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a2Q8BY89 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a2Q8BY89 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a2Q8BY89 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a2Q8BY89 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc44a2Q8BY89 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a2Q8BY89 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc44a2Q8BY89 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a2Q8BY89 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc44a2Q8BY89 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc44a2Q8BY89 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc44a2Q8BY89 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms