Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp38Q8BW70 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp38Q8BW70 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp38Q8BW70 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp38Q8BW70 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp38Q8BW70 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp38Q8BW70 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp38Q8BW70 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp38Q8BW70 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp38Q8BW70 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp38Q8BW70 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp38Q8BW70 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp38Q8BW70 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp38Q8BW70 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp38Q8BW70 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp38Q8BW70 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp38Q8BW70 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp38Q8BW70 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Usp38Q8BW70 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp38Q8BW70 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp38Q8BW70 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp38Q8BW70 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp38Q8BW70 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp38Q8BW70 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp38Q8BW70 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp38Q8BW70 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp38Q8BW70 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp38Q8BW70 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp38Q8BW70 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp38Q8BW70 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp38Q8BW70 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp38Q8BW70 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp38Q8BW70 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp38Q8BW70 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp38Q8BW70 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp38Q8BW70 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp38Q8BW70 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp38Q8BW70 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Usp38Q8BW70 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp38Q8BW70 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp38Q8BW70 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp38Q8BW70 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp38Q8BW70 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp38Q8BW70 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp38Q8BW70 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp38Q8BW70 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp38Q8BW70 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp38Q8BW70 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp38Q8BW70 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp38Q8BW70 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp38Q8BW70 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp38Q8BW70 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp38Q8BW70 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp38Q8BW70 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp38Q8BW70 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp38Q8BW70 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp38Q8BW70 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp38Q8BW70 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp38Q8BW70 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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