Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU47

E330017A01Rik, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330017A01RikQ8BU47 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E330017A01RikQ8BU47 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
E330017A01RikQ8BU47 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E330017A01RikQ8BU47 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E330017A01RikQ8BU47 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E330017A01RikQ8BU47 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E330017A01RikQ8BU47 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E330017A01RikQ8BU47 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E330017A01RikQ8BU47 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E330017A01RikQ8BU47 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E330017A01RikQ8BU47 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E330017A01RikQ8BU47 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E330017A01RikQ8BU47 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E330017A01RikQ8BU47 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E330017A01RikQ8BU47 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E330017A01RikQ8BU47 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E330017A01RikQ8BU47 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E330017A01RikQ8BU47 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E330017A01RikQ8BU47 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E330017A01RikQ8BU47 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E330017A01RikQ8BU47 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms