Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem260Q8BMD6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem260Q8BMD6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem260Q8BMD6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem260Q8BMD6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem260Q8BMD6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem260Q8BMD6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem260Q8BMD6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem260Q8BMD6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem260Q8BMD6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem260Q8BMD6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem260Q8BMD6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem260Q8BMD6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem260Q8BMD6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem260Q8BMD6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem260Q8BMD6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem260Q8BMD6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem260Q8BMD6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem260Q8BMD6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem260Q8BMD6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem260Q8BMD6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem260Q8BMD6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmem260Q8BMD6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem260Q8BMD6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem260Q8BMD6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem260Q8BMD6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem260Q8BMD6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem260Q8BMD6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem260Q8BMD6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem260Q8BMD6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem260Q8BMD6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem260Q8BMD6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem260Q8BMD6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem260Q8BMD6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem260Q8BMD6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem260Q8BMD6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem260Q8BMD6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem260Q8BMD6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem260Q8BMD6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem260Q8BMD6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem260Q8BMD6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem260Q8BMD6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem260Q8BMD6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem260Q8BMD6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem260Q8BMD6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem260Q8BMD6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem260Q8BMD6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem260Q8BMD6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem260Q8BMD6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem260Q8BMD6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmem260Q8BMD6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem260Q8BMD6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem260Q8BMD6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem260Q8BMD6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem260Q8BMD6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem260Q8BMD6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem260Q8BMD6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem260Q8BMD6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem260Q8BMD6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem260Q8BMD6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem260Q8BMD6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmem260Q8BMD6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmem260Q8BMD6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem260Q8BMD6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem260Q8BMD6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem260Q8BMD6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem260Q8BMD6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem260Q8BMD6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmem260Q8BMD6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem260Q8BMD6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem260Q8BMD6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem260Q8BMD6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem260Q8BMD6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem260Q8BMD6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem260Q8BMD6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem260Q8BMD6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmem260Q8BMD6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms