Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smndc1Q8BGT7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smndc1Q8BGT7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smndc1Q8BGT7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smndc1Q8BGT7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smndc1Q8BGT7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms