Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnpo1Q8BFY9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnpo1Q8BFY9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnpo1Q8BFY9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnpo1Q8BFY9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnpo1Q8BFY9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnpo1Q8BFY9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnpo1Q8BFY9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnpo1Q8BFY9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnpo1Q8BFY9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tnpo1Q8BFY9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnpo1Q8BFY9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnpo1Q8BFY9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnpo1Q8BFY9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnpo1Q8BFY9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnpo1Q8BFY9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnpo1Q8BFY9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnpo1Q8BFY9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnpo1Q8BFY9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnpo1Q8BFY9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnpo1Q8BFY9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnpo1Q8BFY9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnpo1Q8BFY9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnpo1Q8BFY9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnpo1Q8BFY9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnpo1Q8BFY9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tnpo1Q8BFY9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tnpo1Q8BFY9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tnpo1Q8BFY9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnpo1Q8BFY9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnpo1Q8BFY9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnpo1Q8BFY9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnpo1Q8BFY9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnpo1Q8BFY9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnpo1Q8BFY9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnpo1Q8BFY9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnpo1Q8BFY9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnpo1Q8BFY9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnpo1Q8BFY9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnpo1Q8BFY9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnpo1Q8BFY9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnpo1Q8BFY9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnpo1Q8BFY9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnpo1Q8BFY9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tnpo1Q8BFY9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tnpo1Q8BFY9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnpo1Q8BFY9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnpo1Q8BFY9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnpo1Q8BFY9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnpo1Q8BFY9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnpo1Q8BFY9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnpo1Q8BFY9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnpo1Q8BFY9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnpo1Q8BFY9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnpo1Q8BFY9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnpo1Q8BFY9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnpo1Q8BFY9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnpo1Q8BFY9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tnpo1Q8BFY9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tnpo1Q8BFY9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnpo1Q8BFY9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnpo1Q8BFY9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnpo1Q8BFY9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnpo1Q8BFY9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnpo1Q8BFY9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnpo1Q8BFY9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnpo1Q8BFY9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnpo1Q8BFY9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnpo1Q8BFY9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnpo1Q8BFY9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnpo1Q8BFY9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnpo1Q8BFY9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnpo1Q8BFY9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnpo1Q8BFY9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnpo1Q8BFY9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnpo1Q8BFY9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnpo1Q8BFY9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnpo1Q8BFY9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnpo1Q8BFY9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tnpo1Q8BFY9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms