Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFQ9

Klhl42, Kelch-like protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl42Q8BFQ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl42Q8BFQ9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl42Q8BFQ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl42Q8BFQ9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl42Q8BFQ9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl42Q8BFQ9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl42Q8BFQ9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl42Q8BFQ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl42Q8BFQ9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl42Q8BFQ9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl42Q8BFQ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl42Q8BFQ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl42Q8BFQ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl42Q8BFQ9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl42Q8BFQ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl42Q8BFQ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl42Q8BFQ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl42Q8BFQ9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl42Q8BFQ9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl42Q8BFQ9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klhl42Q8BFQ9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl42Q8BFQ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl42Q8BFQ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl42Q8BFQ9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl42Q8BFQ9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl42Q8BFQ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl42Q8BFQ9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl42Q8BFQ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl42Q8BFQ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl42Q8BFQ9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl42Q8BFQ9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl42Q8BFQ9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms