Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim19Q80ZU4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim19Q80ZU4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim19Q80ZU4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim19Q80ZU4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim19Q80ZU4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim19Q80ZU4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim19Q80ZU4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim19Q80ZU4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim19Q80ZU4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim19Q80ZU4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim19Q80ZU4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim19Q80ZU4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smim19Q80ZU4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim19Q80ZU4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim19Q80ZU4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smim19Q80ZU4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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