Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ7

Snx32, Sorting nexin-32, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx32Q80ZJ7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx32Q80ZJ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx32Q80ZJ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx32Q80ZJ7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx32Q80ZJ7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx32Q80ZJ7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx32Q80ZJ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx32Q80ZJ7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx32Q80ZJ7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx32Q80ZJ7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx32Q80ZJ7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx32Q80ZJ7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx32Q80ZJ7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx32Q80ZJ7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx32Q80ZJ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx32Q80ZJ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx32Q80ZJ7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx32Q80ZJ7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx32Q80ZJ7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx32Q80ZJ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx32Q80ZJ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx32Q80ZJ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx32Q80ZJ7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx32Q80ZJ7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx32Q80ZJ7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx32Q80ZJ7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx32Q80ZJ7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx32Q80ZJ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx32Q80ZJ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx32Q80ZJ7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx32Q80ZJ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx32Q80ZJ7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snx32Q80ZJ7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx32Q80ZJ7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx32Q80ZJ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx32Q80ZJ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms