Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrsam1Q80ZI6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrsam1Q80ZI6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrsam1Q80ZI6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrsam1Q80ZI6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrsam1Q80ZI6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrsam1Q80ZI6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrsam1Q80ZI6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrsam1Q80ZI6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrsam1Q80ZI6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrsam1Q80ZI6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrsam1Q80ZI6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrsam1Q80ZI6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrsam1Q80ZI6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrsam1Q80ZI6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrsam1Q80ZI6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrsam1Q80ZI6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrsam1Q80ZI6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrsam1Q80ZI6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrsam1Q80ZI6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrsam1Q80ZI6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrsam1Q80ZI6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrsam1Q80ZI6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrsam1Q80ZI6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrsam1Q80ZI6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrsam1Q80ZI6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrsam1Q80ZI6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrsam1Q80ZI6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrsam1Q80ZI6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrsam1Q80ZI6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrsam1Q80ZI6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrsam1Q80ZI6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrsam1Q80ZI6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrsam1Q80ZI6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrsam1Q80ZI6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrsam1Q80ZI6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrsam1Q80ZI6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrsam1Q80ZI6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrsam1Q80ZI6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrsam1Q80ZI6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrsam1Q80ZI6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrsam1Q80ZI6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrsam1Q80ZI6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lrsam1Q80ZI6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrsam1Q80ZI6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrsam1Q80ZI6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrsam1Q80ZI6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrsam1Q80ZI6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrsam1Q80ZI6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrsam1Q80ZI6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrsam1Q80ZI6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrsam1Q80ZI6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrsam1Q80ZI6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrsam1Q80ZI6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrsam1Q80ZI6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrsam1Q80ZI6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrsam1Q80ZI6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrsam1Q80ZI6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrsam1Q80ZI6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrsam1Q80ZI6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrsam1Q80ZI6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms