Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IfneQ80ZF2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IfneQ80ZF2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IfneQ80ZF2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IfneQ80ZF2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IfneQ80ZF2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IfneQ80ZF2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IfneQ80ZF2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IfneQ80ZF2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IfneQ80ZF2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IfneQ80ZF2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IfneQ80ZF2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IfneQ80ZF2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IfneQ80ZF2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IfneQ80ZF2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IfneQ80ZF2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IfneQ80ZF2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IfneQ80ZF2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IfneQ80ZF2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IfneQ80ZF2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IfneQ80ZF2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IfneQ80ZF2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IfneQ80ZF2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IfneQ80ZF2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IfneQ80ZF2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IfneQ80ZF2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IfneQ80ZF2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IfneQ80ZF2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IfneQ80ZF2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IfneQ80ZF2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IfneQ80ZF2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IfneQ80ZF2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IfneQ80ZF2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IfneQ80ZF2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IfneQ80ZF2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IfneQ80ZF2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms