Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nrde2Q80XC6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nrde2Q80XC6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nrde2Q80XC6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nrde2Q80XC6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nrde2Q80XC6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nrde2Q80XC6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nrde2Q80XC6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nrde2Q80XC6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nrde2Q80XC6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nrde2Q80XC6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nrde2Q80XC6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nrde2Q80XC6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nrde2Q80XC6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nrde2Q80XC6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nrde2Q80XC6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Nrde2Q80XC6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nrde2Q80XC6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrde2Q80XC6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms