Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sgo2Q7TSY8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sgo2Q7TSY8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgo2Q7TSY8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgo2Q7TSY8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgo2Q7TSY8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgo2Q7TSY8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgo2Q7TSY8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgo2Q7TSY8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgo2Q7TSY8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgo2Q7TSY8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgo2Q7TSY8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgo2Q7TSY8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgo2Q7TSY8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sgo2Q7TSY8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sgo2Q7TSY8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sgo2Q7TSY8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sgo2Q7TSY8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sgo2Q7TSY8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sgo2Q7TSY8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sgo2Q7TSY8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgo2Q7TSY8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgo2Q7TSY8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sgo2Q7TSY8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sgo2Q7TSY8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sgo2Q7TSY8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sgo2Q7TSY8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sgo2Q7TSY8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sgo2Q7TSY8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sgo2Q7TSY8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sgo2Q7TSY8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sgo2Q7TSY8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sgo2Q7TSY8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sgo2Q7TSY8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sgo2Q7TSY8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sgo2Q7TSY8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sgo2Q7TSY8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sgo2Q7TSY8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgo2Q7TSY8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgo2Q7TSY8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgo2Q7TSY8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgo2Q7TSY8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sgo2Q7TSY8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sgo2Q7TSY8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sgo2Q7TSY8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sgo2Q7TSY8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sgo2Q7TSY8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sgo2Q7TSY8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sgo2Q7TSY8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sgo2Q7TSY8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sgo2Q7TSY8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgo2Q7TSY8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgo2Q7TSY8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgo2Q7TSY8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sgo2Q7TSY8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sgo2Q7TSY8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sgo2Q7TSY8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sgo2Q7TSY8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sgo2Q7TSY8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sgo2Q7TSY8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sgo2Q7TSY8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgo2Q7TSY8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms