Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zfp397Q7TNK4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zfp397Q7TNK4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zfp397Q7TNK4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zfp397Q7TNK4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zfp397Q7TNK4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zfp397Q7TNK4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zfp397Q7TNK4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zfp397Q7TNK4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Zfp397Q7TNK4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zfp397Q7TNK4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zfp397Q7TNK4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zfp397Q7TNK4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zfp397Q7TNK4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zfp397Q7TNK4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zfp397Q7TNK4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zfp397Q7TNK4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zfp397Q7TNK4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zfp397Q7TNK4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zfp397Q7TNK4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zfp397Q7TNK4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zfp397Q7TNK4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zfp397Q7TNK4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp397Q7TNK4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp397Q7TNK4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp397Q7TNK4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp397Q7TNK4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp397Q7TNK4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp397Q7TNK4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zfp397Q7TNK4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zfp397Q7TNK4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zfp397Q7TNK4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zfp397Q7TNK4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zfp397Q7TNK4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zfp397Q7TNK4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zfp397Q7TNK4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms