Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TwistnbQ78WZ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TwistnbQ78WZ7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TwistnbQ78WZ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TwistnbQ78WZ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TwistnbQ78WZ7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TwistnbQ78WZ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TwistnbQ78WZ7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TwistnbQ78WZ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TwistnbQ78WZ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TwistnbQ78WZ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TwistnbQ78WZ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TwistnbQ78WZ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TwistnbQ78WZ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TwistnbQ78WZ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TwistnbQ78WZ7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TwistnbQ78WZ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TwistnbQ78WZ7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TwistnbQ78WZ7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TwistnbQ78WZ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TwistnbQ78WZ7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TwistnbQ78WZ7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TwistnbQ78WZ7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TwistnbQ78WZ7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms