Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY3

Rps27l, 40S ribosomal protein S27-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27lQ6ZWY3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps27lQ6ZWY3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps27lQ6ZWY3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps27lQ6ZWY3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps27lQ6ZWY3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rps27lQ6ZWY3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rps27lQ6ZWY3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rps27lQ6ZWY3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps27lQ6ZWY3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps27lQ6ZWY3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps27lQ6ZWY3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rps27lQ6ZWY3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps27lQ6ZWY3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps27lQ6ZWY3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms