Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPF4

Fmnl3, Formin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmnl3Q6ZPF4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fmnl3Q6ZPF4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fmnl3Q6ZPF4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fmnl3Q6ZPF4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fmnl3Q6ZPF4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fmnl3Q6ZPF4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fmnl3Q6ZPF4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fmnl3Q6ZPF4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmnl3Q6ZPF4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmnl3Q6ZPF4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fmnl3Q6ZPF4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fmnl3Q6ZPF4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fmnl3Q6ZPF4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fmnl3Q6ZPF4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fmnl3Q6ZPF4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fmnl3Q6ZPF4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fmnl3Q6ZPF4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fmnl3Q6ZPF4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fmnl3Q6ZPF4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fmnl3Q6ZPF4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fmnl3Q6ZPF4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fmnl3Q6ZPF4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fmnl3Q6ZPF4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fmnl3Q6ZPF4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fmnl3Q6ZPF4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fmnl3Q6ZPF4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fmnl3Q6ZPF4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmnl3Q6ZPF4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fmnl3Q6ZPF4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fmnl3Q6ZPF4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fmnl3Q6ZPF4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fmnl3Q6ZPF4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fmnl3Q6ZPF4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fmnl3Q6ZPF4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms