Protein–RNA interactions for Protein: Q6RKD8

Flrt1, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flrt1Q6RKD8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Flrt1Q6RKD8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Flrt1Q6RKD8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Flrt1Q6RKD8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Flrt1Q6RKD8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Flrt1Q6RKD8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Flrt1Q6RKD8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Flrt1Q6RKD8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Flrt1Q6RKD8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Flrt1Q6RKD8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Flrt1Q6RKD8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Flrt1Q6RKD8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Flrt1Q6RKD8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Flrt1Q6RKD8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Flrt1Q6RKD8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Flrt1Q6RKD8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms