Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nudcd1Q6PIP5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nudcd1Q6PIP5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nudcd1Q6PIP5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nudcd1Q6PIP5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nudcd1Q6PIP5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nudcd1Q6PIP5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nudcd1Q6PIP5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nudcd1Q6PIP5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nudcd1Q6PIP5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nudcd1Q6PIP5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nudcd1Q6PIP5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nudcd1Q6PIP5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nudcd1Q6PIP5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nudcd1Q6PIP5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Nudcd1Q6PIP5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nudcd1Q6PIP5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nudcd1Q6PIP5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nudcd1Q6PIP5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nudcd1Q6PIP5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nudcd1Q6PIP5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nudcd1Q6PIP5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nudcd1Q6PIP5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nudcd1Q6PIP5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nudcd1Q6PIP5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nudcd1Q6PIP5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nudcd1Q6PIP5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nudcd1Q6PIP5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nudcd1Q6PIP5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nudcd1Q6PIP5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nudcd1Q6PIP5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nudcd1Q6PIP5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nudcd1Q6PIP5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nudcd1Q6PIP5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nudcd1Q6PIP5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nudcd1Q6PIP5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nudcd1Q6PIP5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nudcd1Q6PIP5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nudcd1Q6PIP5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nudcd1Q6PIP5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nudcd1Q6PIP5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nudcd1Q6PIP5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nudcd1Q6PIP5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nudcd1Q6PIP5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nudcd1Q6PIP5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nudcd1Q6PIP5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nudcd1Q6PIP5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nudcd1Q6PIP5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nudcd1Q6PIP5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nudcd1Q6PIP5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nudcd1Q6PIP5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nudcd1Q6PIP5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nudcd1Q6PIP5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nudcd1Q6PIP5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms