Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1a2Q6PIE5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1a2Q6PIE5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1a2Q6PIE5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1a2Q6PIE5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1a2Q6PIE5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp1a2Q6PIE5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp1a2Q6PIE5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp1a2Q6PIE5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp1a2Q6PIE5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1a2Q6PIE5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 514.9 ms