Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ecm29Q6PDI5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ecm29Q6PDI5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ecm29Q6PDI5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ecm29Q6PDI5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ecm29Q6PDI5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ecm29Q6PDI5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ecm29Q6PDI5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ecm29Q6PDI5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ecm29Q6PDI5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ecm29Q6PDI5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ecm29Q6PDI5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ecm29Q6PDI5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ecm29Q6PDI5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ecm29Q6PDI5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ecm29Q6PDI5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ecm29Q6PDI5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ecm29Q6PDI5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ecm29Q6PDI5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ecm29Q6PDI5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ecm29Q6PDI5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ecm29Q6PDI5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ecm29Q6PDI5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ecm29Q6PDI5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ecm29Q6PDI5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ecm29Q6PDI5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ecm29Q6PDI5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ecm29Q6PDI5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ecm29Q6PDI5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ecm29Q6PDI5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ecm29Q6PDI5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ecm29Q6PDI5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ecm29Q6PDI5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ecm29Q6PDI5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ecm29Q6PDI5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ecm29Q6PDI5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ecm29Q6PDI5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ecm29Q6PDI5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ecm29Q6PDI5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ecm29Q6PDI5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ecm29Q6PDI5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ecm29Q6PDI5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ecm29Q6PDI5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ecm29Q6PDI5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ecm29Q6PDI5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ecm29Q6PDI5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ecm29Q6PDI5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ecm29Q6PDI5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ecm29Q6PDI5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ecm29Q6PDI5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ecm29Q6PDI5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ecm29Q6PDI5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ecm29Q6PDI5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ecm29Q6PDI5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ecm29Q6PDI5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ecm29Q6PDI5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ecm29Q6PDI5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ecm29Q6PDI5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ecm29Q6PDI5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ecm29Q6PDI5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ecm29Q6PDI5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ecm29Q6PDI5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ecm29Q6PDI5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ecm29Q6PDI5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ecm29Q6PDI5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ecm29Q6PDI5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ecm29Q6PDI5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ecm29Q6PDI5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ecm29Q6PDI5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ecm29Q6PDI5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ecm29Q6PDI5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ecm29Q6PDI5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ecm29Q6PDI5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ecm29Q6PDI5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ecm29Q6PDI5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ecm29Q6PDI5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ecm29Q6PDI5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ecm29Q6PDI5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ecm29Q6PDI5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ecm29Q6PDI5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ecm29Q6PDI5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms