Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SvoplQ6PDF3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SvoplQ6PDF3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SvoplQ6PDF3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SvoplQ6PDF3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SvoplQ6PDF3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SvoplQ6PDF3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SvoplQ6PDF3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SvoplQ6PDF3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SvoplQ6PDF3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SvoplQ6PDF3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SvoplQ6PDF3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SvoplQ6PDF3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SvoplQ6PDF3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SvoplQ6PDF3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SvoplQ6PDF3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SvoplQ6PDF3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SvoplQ6PDF3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SvoplQ6PDF3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133 ms