Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trak2Q6P9N8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trak2Q6P9N8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trak2Q6P9N8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trak2Q6P9N8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trak2Q6P9N8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak2Q6P9N8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak2Q6P9N8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak2Q6P9N8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak2Q6P9N8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak2Q6P9N8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak2Q6P9N8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak2Q6P9N8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trak2Q6P9N8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trak2Q6P9N8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trak2Q6P9N8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trak2Q6P9N8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trak2Q6P9N8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trak2Q6P9N8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trak2Q6P9N8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trak2Q6P9N8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trak2Q6P9N8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trak2Q6P9N8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trak2Q6P9N8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trak2Q6P9N8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trak2Q6P9N8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trak2Q6P9N8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trak2Q6P9N8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trak2Q6P9N8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trak2Q6P9N8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trak2Q6P9N8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trak2Q6P9N8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trak2Q6P9N8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trak2Q6P9N8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trak2Q6P9N8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trak2Q6P9N8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trak2Q6P9N8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trak2Q6P9N8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trak2Q6P9N8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trak2Q6P9N8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trak2Q6P9N8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trak2Q6P9N8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trak2Q6P9N8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trak2Q6P9N8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trak2Q6P9N8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trak2Q6P9N8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trak2Q6P9N8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trak2Q6P9N8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trak2Q6P9N8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trak2Q6P9N8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Trak2Q6P9N8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trak2Q6P9N8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trak2Q6P9N8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trak2Q6P9N8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trak2Q6P9N8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trak2Q6P9N8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trak2Q6P9N8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trak2Q6P9N8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trak2Q6P9N8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trak2Q6P9N8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trak2Q6P9N8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trak2Q6P9N8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trak2Q6P9N8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trak2Q6P9N8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trak2Q6P9N8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trak2Q6P9N8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trak2Q6P9N8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trak2Q6P9N8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trak2Q6P9N8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trak2Q6P9N8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trak2Q6P9N8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trak2Q6P9N8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trak2Q6P9N8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trak2Q6P9N8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trak2Q6P9N8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Trak2Q6P9N8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trak2Q6P9N8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trak2Q6P9N8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trak2Q6P9N8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms