Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sik3Q6P4S6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sik3Q6P4S6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sik3Q6P4S6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sik3Q6P4S6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Sik3Q6P4S6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sik3Q6P4S6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sik3Q6P4S6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sik3Q6P4S6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sik3Q6P4S6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sik3Q6P4S6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sik3Q6P4S6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sik3Q6P4S6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sik3Q6P4S6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Sik3Q6P4S6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sik3Q6P4S6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sik3Q6P4S6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sik3Q6P4S6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sik3Q6P4S6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sik3Q6P4S6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sik3Q6P4S6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sik3Q6P4S6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sik3Q6P4S6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sik3Q6P4S6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sik3Q6P4S6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sik3Q6P4S6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sik3Q6P4S6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sik3Q6P4S6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sik3Q6P4S6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sik3Q6P4S6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sik3Q6P4S6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sik3Q6P4S6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sik3Q6P4S6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sik3Q6P4S6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sik3Q6P4S6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sik3Q6P4S6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sik3Q6P4S6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sik3Q6P4S6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sik3Q6P4S6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sik3Q6P4S6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sik3Q6P4S6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sik3Q6P4S6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sik3Q6P4S6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sik3Q6P4S6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Sik3Q6P4S6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sik3Q6P4S6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sik3Q6P4S6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sik3Q6P4S6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sik3Q6P4S6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sik3Q6P4S6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sik3Q6P4S6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sik3Q6P4S6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sik3Q6P4S6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sik3Q6P4S6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sik3Q6P4S6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sik3Q6P4S6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sik3Q6P4S6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sik3Q6P4S6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sik3Q6P4S6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sik3Q6P4S6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sik3Q6P4S6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sik3Q6P4S6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sik3Q6P4S6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sik3Q6P4S6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sik3Q6P4S6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sik3Q6P4S6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sik3Q6P4S6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sik3Q6P4S6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sik3Q6P4S6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sik3Q6P4S6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sik3Q6P4S6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sik3Q6P4S6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sik3Q6P4S6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sik3Q6P4S6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sik3Q6P4S6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sik3Q6P4S6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sik3Q6P4S6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sik3Q6P4S6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sik3Q6P4S6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sik3Q6P4S6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sik3Q6P4S6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sik3Q6P4S6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sik3Q6P4S6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sik3Q6P4S6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Sik3Q6P4S6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sik3Q6P4S6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sik3Q6P4S6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sik3Q6P4S6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sik3Q6P4S6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sik3Q6P4S6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sik3Q6P4S6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sik3Q6P4S6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sik3Q6P4S6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sik3Q6P4S6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sik3Q6P4S6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sik3Q6P4S6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sik3Q6P4S6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sik3Q6P4S6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sik3Q6P4S6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sik3Q6P4S6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms