Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL8

Scube1, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube1Q6NZL8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scube1Q6NZL8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scube1Q6NZL8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scube1Q6NZL8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scube1Q6NZL8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scube1Q6NZL8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scube1Q6NZL8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scube1Q6NZL8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scube1Q6NZL8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scube1Q6NZL8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scube1Q6NZL8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scube1Q6NZL8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scube1Q6NZL8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scube1Q6NZL8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scube1Q6NZL8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scube1Q6NZL8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scube1Q6NZL8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scube1Q6NZL8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scube1Q6NZL8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scube1Q6NZL8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scube1Q6NZL8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scube1Q6NZL8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scube1Q6NZL8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scube1Q6NZL8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scube1Q6NZL8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scube1Q6NZL8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scube1Q6NZL8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scube1Q6NZL8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scube1Q6NZL8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scube1Q6NZL8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms