Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZB1

Prmt6, Protein arginine N-methyltransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt6Q6NZB1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prmt6Q6NZB1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prmt6Q6NZB1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prmt6Q6NZB1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Prmt6Q6NZB1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prmt6Q6NZB1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Prmt6Q6NZB1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prmt6Q6NZB1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prmt6Q6NZB1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prmt6Q6NZB1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prmt6Q6NZB1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prmt6Q6NZB1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Prmt6Q6NZB1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prmt6Q6NZB1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prmt6Q6NZB1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prmt6Q6NZB1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prmt6Q6NZB1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Prmt6Q6NZB1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prmt6Q6NZB1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prmt6Q6NZB1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Prmt6Q6NZB1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prmt6Q6NZB1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prmt6Q6NZB1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prmt6Q6NZB1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prmt6Q6NZB1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Prmt6Q6NZB1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prmt6Q6NZB1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prmt6Q6NZB1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prmt6Q6NZB1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prmt6Q6NZB1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prmt6Q6NZB1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prmt6Q6NZB1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prmt6Q6NZB1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prmt6Q6NZB1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Prmt6Q6NZB1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prmt6Q6NZB1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prmt6Q6NZB1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Prmt6Q6NZB1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prmt6Q6NZB1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prmt6Q6NZB1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prmt6Q6NZB1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prmt6Q6NZB1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prmt6Q6NZB1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Prmt6Q6NZB1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prmt6Q6NZB1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Prmt6Q6NZB1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prmt6Q6NZB1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prmt6Q6NZB1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prmt6Q6NZB1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prmt6Q6NZB1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prmt6Q6NZB1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prmt6Q6NZB1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Prmt6Q6NZB1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prmt6Q6NZB1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prmt6Q6NZB1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prmt6Q6NZB1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prmt6Q6NZB1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prmt6Q6NZB1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Prmt6Q6NZB1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prmt6Q6NZB1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prmt6Q6NZB1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prmt6Q6NZB1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prmt6Q6NZB1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prmt6Q6NZB1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Prmt6Q6NZB1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prmt6Q6NZB1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prmt6Q6NZB1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prmt6Q6NZB1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prmt6Q6NZB1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Prmt6Q6NZB1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prmt6Q6NZB1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prmt6Q6NZB1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms