Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SphkapQ6NSW3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SphkapQ6NSW3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SphkapQ6NSW3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SphkapQ6NSW3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SphkapQ6NSW3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SphkapQ6NSW3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SphkapQ6NSW3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SphkapQ6NSW3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SphkapQ6NSW3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SphkapQ6NSW3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SphkapQ6NSW3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SphkapQ6NSW3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SphkapQ6NSW3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SphkapQ6NSW3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SphkapQ6NSW3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SphkapQ6NSW3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SphkapQ6NSW3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SphkapQ6NSW3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SphkapQ6NSW3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SphkapQ6NSW3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SphkapQ6NSW3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SphkapQ6NSW3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SphkapQ6NSW3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SphkapQ6NSW3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SphkapQ6NSW3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SphkapQ6NSW3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SphkapQ6NSW3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SphkapQ6NSW3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SphkapQ6NSW3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SphkapQ6NSW3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SphkapQ6NSW3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SphkapQ6NSW3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
SphkapQ6NSW3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SphkapQ6NSW3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SphkapQ6NSW3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SphkapQ6NSW3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SphkapQ6NSW3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SphkapQ6NSW3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SphkapQ6NSW3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
SphkapQ6NSW3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SphkapQ6NSW3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SphkapQ6NSW3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
SphkapQ6NSW3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SphkapQ6NSW3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SphkapQ6NSW3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SphkapQ6NSW3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SphkapQ6NSW3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SphkapQ6NSW3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SphkapQ6NSW3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SphkapQ6NSW3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SphkapQ6NSW3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SphkapQ6NSW3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SphkapQ6NSW3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SphkapQ6NSW3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SphkapQ6NSW3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SphkapQ6NSW3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
SphkapQ6NSW3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SphkapQ6NSW3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SphkapQ6NSW3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SphkapQ6NSW3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SphkapQ6NSW3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SphkapQ6NSW3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SphkapQ6NSW3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SphkapQ6NSW3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
SphkapQ6NSW3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
SphkapQ6NSW3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SphkapQ6NSW3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SphkapQ6NSW3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SphkapQ6NSW3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
SphkapQ6NSW3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SphkapQ6NSW3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SphkapQ6NSW3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SphkapQ6NSW3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SphkapQ6NSW3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SphkapQ6NSW3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
SphkapQ6NSW3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SphkapQ6NSW3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SphkapQ6NSW3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SphkapQ6NSW3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SphkapQ6NSW3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms