Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap20Q6IFT4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgap20Q6IFT4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arhgap20Q6IFT4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arhgap20Q6IFT4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arhgap20Q6IFT4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arhgap20Q6IFT4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arhgap20Q6IFT4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arhgap20Q6IFT4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Arhgap20Q6IFT4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arhgap20Q6IFT4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arhgap20Q6IFT4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arhgap20Q6IFT4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arhgap20Q6IFT4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap20Q6IFT4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap20Q6IFT4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgap20Q6IFT4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arhgap20Q6IFT4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arhgap20Q6IFT4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap20Q6IFT4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap20Q6IFT4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arhgap20Q6IFT4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgap20Q6IFT4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arhgap20Q6IFT4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms