Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lemd2Q6DVA0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lemd2Q6DVA0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lemd2Q6DVA0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lemd2Q6DVA0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lemd2Q6DVA0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lemd2Q6DVA0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lemd2Q6DVA0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lemd2Q6DVA0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lemd2Q6DVA0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lemd2Q6DVA0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lemd2Q6DVA0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lemd2Q6DVA0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lemd2Q6DVA0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lemd2Q6DVA0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lemd2Q6DVA0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lemd2Q6DVA0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lemd2Q6DVA0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lemd2Q6DVA0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lemd2Q6DVA0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lemd2Q6DVA0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lemd2Q6DVA0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lemd2Q6DVA0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lemd2Q6DVA0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lemd2Q6DVA0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lemd2Q6DVA0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lemd2Q6DVA0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lemd2Q6DVA0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lemd2Q6DVA0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lemd2Q6DVA0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lemd2Q6DVA0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lemd2Q6DVA0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lemd2Q6DVA0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lemd2Q6DVA0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lemd2Q6DVA0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lemd2Q6DVA0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lemd2Q6DVA0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lemd2Q6DVA0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lemd2Q6DVA0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lemd2Q6DVA0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lemd2Q6DVA0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd2Q6DVA0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lemd2Q6DVA0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lemd2Q6DVA0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lemd2Q6DVA0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lemd2Q6DVA0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lemd2Q6DVA0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lemd2Q6DVA0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lemd2Q6DVA0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lemd2Q6DVA0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lemd2Q6DVA0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lemd2Q6DVA0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lemd2Q6DVA0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lemd2Q6DVA0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lemd2Q6DVA0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lemd2Q6DVA0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lemd2Q6DVA0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lemd2Q6DVA0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lemd2Q6DVA0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lemd2Q6DVA0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Lemd2Q6DVA0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms