Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ric1Q69ZJ7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ric1Q69ZJ7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ric1Q69ZJ7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Ric1Q69ZJ7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ric1Q69ZJ7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Ric1Q69ZJ7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ric1Q69ZJ7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ric1Q69ZJ7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ric1Q69ZJ7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ric1Q69ZJ7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ric1Q69ZJ7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Ric1Q69ZJ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ric1Q69ZJ7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ric1Q69ZJ7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ric1Q69ZJ7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ric1Q69ZJ7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ric1Q69ZJ7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ric1Q69ZJ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ric1Q69ZJ7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ric1Q69ZJ7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ric1Q69ZJ7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ric1Q69ZJ7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ric1Q69ZJ7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ric1Q69ZJ7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ric1Q69ZJ7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ric1Q69ZJ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ric1Q69ZJ7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Ric1Q69ZJ7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ric1Q69ZJ7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ric1Q69ZJ7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ric1Q69ZJ7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ric1Q69ZJ7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ric1Q69ZJ7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ric1Q69ZJ7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Ric1Q69ZJ7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ric1Q69ZJ7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ric1Q69ZJ7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ric1Q69ZJ7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ric1Q69ZJ7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Ric1Q69ZJ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ric1Q69ZJ7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ric1Q69ZJ7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ric1Q69ZJ7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ric1Q69ZJ7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ric1Q69ZJ7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ric1Q69ZJ7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ric1Q69ZJ7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ric1Q69ZJ7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ric1Q69ZJ7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ric1Q69ZJ7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ric1Q69ZJ7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Ric1Q69ZJ7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ric1Q69ZJ7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Ric1Q69ZJ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ric1Q69ZJ7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ric1Q69ZJ7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ric1Q69ZJ7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ric1Q69ZJ7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ric1Q69ZJ7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ric1Q69ZJ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ric1Q69ZJ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ric1Q69ZJ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ric1Q69ZJ7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ric1Q69ZJ7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ric1Q69ZJ7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ric1Q69ZJ7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Ric1Q69ZJ7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ric1Q69ZJ7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ric1Q69ZJ7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ric1Q69ZJ7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ric1Q69ZJ7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ric1Q69ZJ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ric1Q69ZJ7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ric1Q69ZJ7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ric1Q69ZJ7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ric1Q69ZJ7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ric1Q69ZJ7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ric1Q69ZJ7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ric1Q69ZJ7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ric1Q69ZJ7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms