Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF7

Slain1, SLAIN motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slain1Q68FF7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slain1Q68FF7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Slain1Q68FF7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slain1Q68FF7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slain1Q68FF7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slain1Q68FF7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slain1Q68FF7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slain1Q68FF7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Slain1Q68FF7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slain1Q68FF7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slain1Q68FF7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slain1Q68FF7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slain1Q68FF7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slain1Q68FF7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slain1Q68FF7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slain1Q68FF7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slain1Q68FF7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slain1Q68FF7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slain1Q68FF7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Slain1Q68FF7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slain1Q68FF7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slain1Q68FF7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slain1Q68FF7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Slain1Q68FF7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slain1Q68FF7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Slain1Q68FF7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slain1Q68FF7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slain1Q68FF7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slain1Q68FF7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slain1Q68FF7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slain1Q68FF7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Slain1Q68FF7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Slain1Q68FF7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slain1Q68FF7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slain1Q68FF7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slain1Q68FF7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slain1Q68FF7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slain1Q68FF7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slain1Q68FF7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Slain1Q68FF7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slain1Q68FF7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slain1Q68FF7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Slain1Q68FF7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Slain1Q68FF7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Slain1Q68FF7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slain1Q68FF7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Slain1Q68FF7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Slain1Q68FF7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Slain1Q68FF7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Slain1Q68FF7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.55■■■□□ 2
Slain1Q68FF7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Slain1Q68FF7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slain1Q68FF7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slain1Q68FF7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Slain1Q68FF7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slain1Q68FF7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Slain1Q68FF7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slain1Q68FF7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Slain1Q68FF7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slain1Q68FF7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slain1Q68FF7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slain1Q68FF7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slain1Q68FF7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slain1Q68FF7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slain1Q68FF7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slain1Q68FF7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slain1Q68FF7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slain1Q68FF7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slain1Q68FF7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slain1Q68FF7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Slain1Q68FF7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slain1Q68FF7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slain1Q68FF7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slain1Q68FF7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slain1Q68FF7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slain1Q68FF7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slain1Q68FF7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slain1Q68FF7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slain1Q68FF7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Slain1Q68FF7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slain1Q68FF7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slain1Q68FF7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slain1Q68FF7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slain1Q68FF7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slain1Q68FF7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slain1Q68FF7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slain1Q68FF7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slain1Q68FF7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Slain1Q68FF7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slain1Q68FF7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slain1Q68FF7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slain1Q68FF7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Slain1Q68FF7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slain1Q68FF7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slain1Q68FF7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slain1Q68FF7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slain1Q68FF7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slain1Q68FF7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slain1Q68FF7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slain1Q68FF7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms