Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q66JV7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q66JV7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q66JV7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q66JV7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Q66JV7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q66JV7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q66JV7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q66JV7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q66JV7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q66JV7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q66JV7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q66JV7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q66JV7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q66JV7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q66JV7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q66JV7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q66JV7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q66JV7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q66JV7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q66JV7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q66JV7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q66JV7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q66JV7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q66JV7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q66JV7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q66JV7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q66JV7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q66JV7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q66JV7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q66JV7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q66JV7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q66JV7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q66JV7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q66JV7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q66JV7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q66JV7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q66JV7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q66JV7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q66JV7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q66JV7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q66JV7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q66JV7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Q66JV7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q66JV7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q66JV7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q66JV7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q66JV7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q66JV7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q66JV7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q66JV7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q66JV7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q66JV7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q66JV7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Q66JV7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q66JV7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q66JV7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q66JV7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q66JV7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q66JV7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q66JV7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q66JV7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q66JV7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q66JV7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q66JV7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q66JV7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q66JV7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q66JV7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q66JV7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q66JV7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q66JV7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q66JV7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q66JV7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q66JV7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q66JV7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q66JV7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q66JV7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q66JV7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q66JV7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q66JV7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q66JV7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q66JV7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q66JV7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q66JV7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q66JV7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Q66JV7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Q66JV7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q66JV7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q66JV7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q66JV7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q66JV7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q66JV7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Q66JV7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q66JV7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Q66JV7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q66JV7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q66JV7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q66JV7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Q66JV7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q66JV7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms