Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc8eQ66JT1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc8eQ66JT1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc8eQ66JT1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc8eQ66JT1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc8eQ66JT1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc8eQ66JT1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc8eQ66JT1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc8eQ66JT1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc8eQ66JT1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc8eQ66JT1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc8eQ66JT1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc8eQ66JT1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc8eQ66JT1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc8eQ66JT1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc8eQ66JT1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc8eQ66JT1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc8eQ66JT1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc8eQ66JT1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc8eQ66JT1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc8eQ66JT1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc8eQ66JT1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc8eQ66JT1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc8eQ66JT1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc8eQ66JT1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc8eQ66JT1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc8eQ66JT1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc8eQ66JT1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc8eQ66JT1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc8eQ66JT1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc8eQ66JT1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc8eQ66JT1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc8eQ66JT1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc8eQ66JT1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc8eQ66JT1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms