Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps72Q62481 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps72Q62481 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps72Q62481 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps72Q62481 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps72Q62481 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps72Q62481 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps72Q62481 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps72Q62481 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps72Q62481 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps72Q62481 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps72Q62481 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps72Q62481 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps72Q62481 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps72Q62481 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps72Q62481 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps72Q62481 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps72Q62481 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps72Q62481 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps72Q62481 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps72Q62481 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps72Q62481 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps72Q62481 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps72Q62481 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps72Q62481 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps72Q62481 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps72Q62481 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps72Q62481 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps72Q62481 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps72Q62481 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps72Q62481 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps72Q62481 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps72Q62481 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps72Q62481 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps72Q62481 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps72Q62481 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps72Q62481 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps72Q62481 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps72Q62481 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps72Q62481 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps72Q62481 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps72Q62481 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vps72Q62481 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps72Q62481 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps72Q62481 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps72Q62481 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps72Q62481 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps72Q62481 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps72Q62481 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps72Q62481 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps72Q62481 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps72Q62481 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps72Q62481 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps72Q62481 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps72Q62481 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms