Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccl12Q62401 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccl12Q62401 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccl12Q62401 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl12Q62401 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1371.9 ms