Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Aldh1a2Q62148 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aldh1a2Q62148 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aldh1a2Q62148 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aldh1a2Q62148 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aldh1a2Q62148 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aldh1a2Q62148 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Aldh1a2Q62148 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Aldh1a2Q62148 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Aldh1a2Q62148 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Aldh1a2Q62148 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Aldh1a2Q62148 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Aldh1a2Q62148 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aldh1a2Q62148 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aldh1a2Q62148 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aldh1a2Q62148 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Aldh1a2Q62148 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Aldh1a2Q62148 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Aldh1a2Q62148 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Aldh1a2Q62148 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Aldh1a2Q62148 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Aldh1a2Q62148 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Aldh1a2Q62148 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Aldh1a2Q62148 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Aldh1a2Q62148 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Aldh1a2Q62148 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Aldh1a2Q62148 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Aldh1a2Q62148 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Aldh1a2Q62148 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Aldh1a2Q62148 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Aldh1a2Q62148 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Aldh1a2Q62148 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Aldh1a2Q62148 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Aldh1a2Q62148 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Aldh1a2Q62148 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Aldh1a2Q62148 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Aldh1a2Q62148 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Aldh1a2Q62148 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Aldh1a2Q62148 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Aldh1a2Q62148 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Aldh1a2Q62148 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Aldh1a2Q62148 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Aldh1a2Q62148 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Aldh1a2Q62148 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Aldh1a2Q62148 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Aldh1a2Q62148 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Aldh1a2Q62148 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Aldh1a2Q62148 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Aldh1a2Q62148 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Aldh1a2Q62148 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Aldh1a2Q62148 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aldh1a2Q62148 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aldh1a2Q62148 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aldh1a2Q62148 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Aldh1a2Q62148 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Aldh1a2Q62148 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Aldh1a2Q62148 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Aldh1a2Q62148 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Aldh1a2Q62148 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Aldh1a2Q62148 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Aldh1a2Q62148 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Aldh1a2Q62148 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Aldh1a2Q62148 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Aldh1a2Q62148 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Aldh1a2Q62148 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Aldh1a2Q62148 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Aldh1a2Q62148 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Aldh1a2Q62148 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Aldh1a2Q62148 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Aldh1a2Q62148 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Aldh1a2Q62148 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aldh1a2Q62148 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aldh1a2Q62148 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aldh1a2Q62148 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aldh1a2Q62148 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aldh1a2Q62148 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aldh1a2Q62148 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aldh1a2Q62148 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aldh1a2Q62148 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aldh1a2Q62148 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aldh1a2Q62148 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Aldh1a2Q62148 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aldh1a2Q62148 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aldh1a2Q62148 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aldh1a2Q62148 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aldh1a2Q62148 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aldh1a2Q62148 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aldh1a2Q62148 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aldh1a2Q62148 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.2 ms