Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vsx2Q61412 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vsx2Q61412 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vsx2Q61412 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vsx2Q61412 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vsx2Q61412 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vsx2Q61412 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vsx2Q61412 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vsx2Q61412 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vsx2Q61412 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vsx2Q61412 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vsx2Q61412 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vsx2Q61412 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vsx2Q61412 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vsx2Q61412 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vsx2Q61412 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vsx2Q61412 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vsx2Q61412 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vsx2Q61412 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vsx2Q61412 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vsx2Q61412 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vsx2Q61412 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vsx2Q61412 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vsx2Q61412 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vsx2Q61412 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vsx2Q61412 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vsx2Q61412 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vsx2Q61412 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vsx2Q61412 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vsx2Q61412 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vsx2Q61412 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vsx2Q61412 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vsx2Q61412 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vsx2Q61412 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vsx2Q61412 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vsx2Q61412 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vsx2Q61412 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vsx2Q61412 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vsx2Q61412 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vsx2Q61412 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vsx2Q61412 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vsx2Q61412 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vsx2Q61412 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vsx2Q61412 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Vsx2Q61412 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vsx2Q61412 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vsx2Q61412 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vsx2Q61412 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vsx2Q61412 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vsx2Q61412 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms