Protein–RNA interactions for Protein: Q61066

Nr0b1, Nuclear receptor subfamily 0 group B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr0b1Q61066 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr0b1Q61066 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr0b1Q61066 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr0b1Q61066 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr0b1Q61066 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr0b1Q61066 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr0b1Q61066 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr0b1Q61066 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr0b1Q61066 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr0b1Q61066 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr0b1Q61066 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr0b1Q61066 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr0b1Q61066 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr0b1Q61066 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr0b1Q61066 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr0b1Q61066 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr0b1Q61066 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr0b1Q61066 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr0b1Q61066 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr0b1Q61066 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nr0b1Q61066 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr0b1Q61066 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nr0b1Q61066 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr0b1Q61066 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nr0b1Q61066 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr0b1Q61066 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr0b1Q61066 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nr0b1Q61066 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nr0b1Q61066 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr0b1Q61066 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr0b1Q61066 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr0b1Q61066 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr0b1Q61066 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms