Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc1Q61056 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc1Q61056 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc1Q61056 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc1Q61056 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc1Q61056 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc1Q61056 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc1Q61056 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc1Q61056 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc1Q61056 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc1Q61056 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc1Q61056 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc1Q61056 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc1Q61056 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc1Q61056 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc1Q61056 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc1Q61056 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc1Q61056 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc1Q61056 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc1Q61056 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc1Q61056 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms