Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mkrn3Q60764 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mkrn3Q60764 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Mkrn3Q60764 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mkrn3Q60764 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mkrn3Q60764 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mkrn3Q60764 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Mkrn3Q60764 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mkrn3Q60764 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mkrn3Q60764 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mkrn3Q60764 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mkrn3Q60764 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mkrn3Q60764 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mkrn3Q60764 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mkrn3Q60764 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mkrn3Q60764 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mkrn3Q60764 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mkrn3Q60764 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Mkrn3Q60764 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mkrn3Q60764 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mkrn3Q60764 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mkrn3Q60764 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mkrn3Q60764 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mkrn3Q60764 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mkrn3Q60764 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mkrn3Q60764 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mkrn3Q60764 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mkrn3Q60764 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mkrn3Q60764 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mkrn3Q60764 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mkrn3Q60764 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mkrn3Q60764 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mkrn3Q60764 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mkrn3Q60764 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mkrn3Q60764 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mkrn3Q60764 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mkrn3Q60764 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mkrn3Q60764 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mkrn3Q60764 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Mkrn3Q60764 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mkrn3Q60764 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mkrn3Q60764 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mkrn3Q60764 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mkrn3Q60764 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mkrn3Q60764 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mkrn3Q60764 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mkrn3Q60764 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mkrn3Q60764 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mkrn3Q60764 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mkrn3Q60764 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mkrn3Q60764 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mkrn3Q60764 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mkrn3Q60764 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mkrn3Q60764 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mkrn3Q60764 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mkrn3Q60764 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mkrn3Q60764 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mkrn3Q60764 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mkrn3Q60764 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mkrn3Q60764 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mkrn3Q60764 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mkrn3Q60764 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mkrn3Q60764 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mkrn3Q60764 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mkrn3Q60764 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mkrn3Q60764 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Mkrn3Q60764 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mkrn3Q60764 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mkrn3Q60764 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mkrn3Q60764 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mkrn3Q60764 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mkrn3Q60764 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mkrn3Q60764 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mkrn3Q60764 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Mkrn3Q60764 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mkrn3Q60764 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mkrn3Q60764 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mkrn3Q60764 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mkrn3Q60764 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mkrn3Q60764 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mkrn3Q60764 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mkrn3Q60764 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mkrn3Q60764 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mkrn3Q60764 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mkrn3Q60764 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mkrn3Q60764 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mkrn3Q60764 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mkrn3Q60764 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mkrn3Q60764 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mkrn3Q60764 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mkrn3Q60764 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mkrn3Q60764 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mkrn3Q60764 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Mkrn3Q60764 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mkrn3Q60764 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mkrn3Q60764 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mkrn3Q60764 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mkrn3Q60764 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mkrn3Q60764 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mkrn3Q60764 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms