Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha1Q60750 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Epha1Q60750 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epha1Q60750 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Epha1Q60750 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Epha1Q60750 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Epha1Q60750 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms