Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SkiQ60698 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SkiQ60698 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SkiQ60698 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SkiQ60698 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SkiQ60698 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SkiQ60698 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SkiQ60698 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SkiQ60698 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SkiQ60698 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SkiQ60698 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SkiQ60698 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SkiQ60698 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SkiQ60698 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SkiQ60698 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SkiQ60698 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SkiQ60698 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SkiQ60698 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SkiQ60698 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SkiQ60698 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SkiQ60698 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SkiQ60698 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SkiQ60698 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SkiQ60698 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SkiQ60698 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SkiQ60698 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SkiQ60698 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SkiQ60698 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SkiQ60698 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SkiQ60698 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SkiQ60698 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SkiQ60698 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SkiQ60698 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SkiQ60698 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SkiQ60698 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SkiQ60698 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SkiQ60698 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SkiQ60698 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SkiQ60698 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SkiQ60698 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SkiQ60698 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SkiQ60698 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SkiQ60698 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SkiQ60698 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SkiQ60698 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SkiQ60698 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SkiQ60698 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SkiQ60698 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SkiQ60698 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SkiQ60698 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SkiQ60698 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SkiQ60698 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SkiQ60698 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SkiQ60698 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SkiQ60698 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SkiQ60698 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SkiQ60698 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SkiQ60698 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SkiQ60698 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SkiQ60698 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SkiQ60698 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SkiQ60698 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SkiQ60698 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SkiQ60698 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SkiQ60698 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SkiQ60698 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SkiQ60698 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SkiQ60698 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SkiQ60698 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SkiQ60698 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SkiQ60698 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SkiQ60698 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms