Protein–RNA interactions for Protein: Q60680

Chuk, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChukQ60680 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChukQ60680 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ChukQ60680 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChukQ60680 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChukQ60680 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChukQ60680 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChukQ60680 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChukQ60680 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChukQ60680 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ChukQ60680 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ChukQ60680 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ChukQ60680 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ChukQ60680 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ChukQ60680 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChukQ60680 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ChukQ60680 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChukQ60680 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChukQ60680 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChukQ60680 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChukQ60680 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChukQ60680 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ChukQ60680 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChukQ60680 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ChukQ60680 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChukQ60680 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChukQ60680 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChukQ60680 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChukQ60680 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms