Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC46.33■■■■■ 5.01
NacadQ5SWP3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC46.33■■■■■ 5.01
NacadQ5SWP3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
NacadQ5SWP3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC46.33■■■■■ 5.01
NacadQ5SWP3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
NacadQ5SWP3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
NacadQ5SWP3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
NacadQ5SWP3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5
NacadQ5SWP3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
NacadQ5SWP3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
NacadQ5SWP3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
NacadQ5SWP3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
NacadQ5SWP3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
NacadQ5SWP3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
NacadQ5SWP3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC46.26■■■■■ 5
NacadQ5SWP3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC46.26■■■■■ 5
NacadQ5SWP3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
NacadQ5SWP3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
NacadQ5SWP3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
NacadQ5SWP3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC46.23■■■■■ 4.99
NacadQ5SWP3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC46.22■■■■■ 4.99
NacadQ5SWP3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
NacadQ5SWP3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
NacadQ5SWP3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
NacadQ5SWP3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
NacadQ5SWP3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
NacadQ5SWP3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
NacadQ5SWP3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
NacadQ5SWP3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC46.16■■■■■ 4.98
NacadQ5SWP3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
NacadQ5SWP3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC46.14■■■■■ 4.98
NacadQ5SWP3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
NacadQ5SWP3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
NacadQ5SWP3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.12■■■■■ 4.97
NacadQ5SWP3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC46.11■■■■■ 4.97
NacadQ5SWP3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
NacadQ5SWP3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
NacadQ5SWP3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
NacadQ5SWP3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
NacadQ5SWP3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC46.09■■■■■ 4.97
NacadQ5SWP3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.09■■■■■ 4.97
NacadQ5SWP3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
NacadQ5SWP3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
NacadQ5SWP3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
NacadQ5SWP3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.04■■■■■ 4.96
NacadQ5SWP3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
NacadQ5SWP3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
NacadQ5SWP3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
NacadQ5SWP3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC45.99■■■■■ 4.95
NacadQ5SWP3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
NacadQ5SWP3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC45.98■■■■■ 4.95
NacadQ5SWP3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
NacadQ5SWP3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC45.98■■■■■ 4.95
NacadQ5SWP3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
NacadQ5SWP3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC45.97■■■■■ 4.95
NacadQ5SWP3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC45.96■■■■■ 4.95
NacadQ5SWP3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
NacadQ5SWP3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
NacadQ5SWP3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC45.95■■■■■ 4.95
NacadQ5SWP3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
NacadQ5SWP3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
NacadQ5SWP3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC45.93■■■■■ 4.94
NacadQ5SWP3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
NacadQ5SWP3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
NacadQ5SWP3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC45.93■■■■■ 4.94
NacadQ5SWP3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
NacadQ5SWP3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
NacadQ5SWP3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
NacadQ5SWP3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
NacadQ5SWP3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC45.86■■■■■ 4.93
NacadQ5SWP3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
NacadQ5SWP3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.84■■■■■ 4.93
NacadQ5SWP3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
NacadQ5SWP3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
NacadQ5SWP3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
NacadQ5SWP3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
NacadQ5SWP3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
NacadQ5SWP3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
NacadQ5SWP3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.8■■■■■ 4.92
NacadQ5SWP3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
NacadQ5SWP3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
NacadQ5SWP3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
NacadQ5SWP3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
NacadQ5SWP3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
NacadQ5SWP3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
NacadQ5SWP3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
NacadQ5SWP3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
NacadQ5SWP3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
NacadQ5SWP3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC45.75■■■■■ 4.91
NacadQ5SWP3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
NacadQ5SWP3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.73■■■■■ 4.91
NacadQ5SWP3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
NacadQ5SWP3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC45.73■■■■■ 4.91
NacadQ5SWP3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
NacadQ5SWP3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
NacadQ5SWP3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
NacadQ5SWP3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
NacadQ5SWP3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
NacadQ5SWP3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
NacadQ5SWP3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms