Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Tns3Q5SSZ5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Tns3Q5SSZ5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Tns3Q5SSZ5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Tns3Q5SSZ5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Tns3Q5SSZ5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Tns3Q5SSZ5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Tns3Q5SSZ5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Tns3Q5SSZ5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Tns3Q5SSZ5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Tns3Q5SSZ5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Tns3Q5SSZ5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Tns3Q5SSZ5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Tns3Q5SSZ5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Tns3Q5SSZ5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Tns3Q5SSZ5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Tns3Q5SSZ5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Tns3Q5SSZ5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Tns3Q5SSZ5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Tns3Q5SSZ5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tns3Q5SSZ5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Tns3Q5SSZ5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Tns3Q5SSZ5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Tns3Q5SSZ5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Tns3Q5SSZ5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Tns3Q5SSZ5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Tns3Q5SSZ5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tns3Q5SSZ5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tns3Q5SSZ5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Tns3Q5SSZ5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tns3Q5SSZ5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Tns3Q5SSZ5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Tns3Q5SSZ5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Tns3Q5SSZ5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Tns3Q5SSZ5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Tns3Q5SSZ5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tns3Q5SSZ5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tns3Q5SSZ5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Tns3Q5SSZ5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Tns3Q5SSZ5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Tns3Q5SSZ5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Tns3Q5SSZ5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Tns3Q5SSZ5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Tns3Q5SSZ5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Tns3Q5SSZ5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Tns3Q5SSZ5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Tns3Q5SSZ5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Tns3Q5SSZ5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Tns3Q5SSZ5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Tns3Q5SSZ5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Tns3Q5SSZ5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Tns3Q5SSZ5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Tns3Q5SSZ5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Tns3Q5SSZ5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Tns3Q5SSZ5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Tns3Q5SSZ5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Tns3Q5SSZ5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tns3Q5SSZ5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Tns3Q5SSZ5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Tns3Q5SSZ5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Tns3Q5SSZ5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tns3Q5SSZ5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Tns3Q5SSZ5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tns3Q5SSZ5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tns3Q5SSZ5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Tns3Q5SSZ5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Tns3Q5SSZ5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Tns3Q5SSZ5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Tns3Q5SSZ5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Tns3Q5SSZ5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Tns3Q5SSZ5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Tns3Q5SSZ5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Tns3Q5SSZ5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tns3Q5SSZ5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tns3Q5SSZ5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tns3Q5SSZ5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Tns3Q5SSZ5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Tns3Q5SSZ5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Tns3Q5SSZ5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Tns3Q5SSZ5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Tns3Q5SSZ5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Tns3Q5SSZ5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Tns3Q5SSZ5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Tns3Q5SSZ5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Tns3Q5SSZ5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Tns3Q5SSZ5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Tns3Q5SSZ5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Tns3Q5SSZ5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Tns3Q5SSZ5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Tns3Q5SSZ5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Tns3Q5SSZ5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Tns3Q5SSZ5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Tns3Q5SSZ5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Tns3Q5SSZ5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Tns3Q5SSZ5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Tns3Q5SSZ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Tns3Q5SSZ5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Tns3Q5SSZ5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Tns3Q5SSZ5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Tns3Q5SSZ5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms