Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
5730522E02RikQ5SP45 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
5730522E02RikQ5SP45 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
5730522E02RikQ5SP45 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
5730522E02RikQ5SP45 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
5730522E02RikQ5SP45 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
5730522E02RikQ5SP45 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
5730522E02RikQ5SP45 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
5730522E02RikQ5SP45 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
5730522E02RikQ5SP45 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
5730522E02RikQ5SP45 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
5730522E02RikQ5SP45 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
5730522E02RikQ5SP45 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
5730522E02RikQ5SP45 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
5730522E02RikQ5SP45 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
5730522E02RikQ5SP45 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
5730522E02RikQ5SP45 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
5730522E02RikQ5SP45 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5730522E02RikQ5SP45 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5730522E02RikQ5SP45 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
5730522E02RikQ5SP45 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
5730522E02RikQ5SP45 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
5730522E02RikQ5SP45 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730522E02RikQ5SP45 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730522E02RikQ5SP45 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730522E02RikQ5SP45 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730522E02RikQ5SP45 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730522E02RikQ5SP45 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
5730522E02RikQ5SP45 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730522E02RikQ5SP45 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730522E02RikQ5SP45 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730522E02RikQ5SP45 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730522E02RikQ5SP45 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
5730522E02RikQ5SP45 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
5730522E02RikQ5SP45 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms