Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SynaQ5G5D5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SynaQ5G5D5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SynaQ5G5D5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SynaQ5G5D5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynaQ5G5D5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynaQ5G5D5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SynaQ5G5D5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SynaQ5G5D5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynaQ5G5D5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SynaQ5G5D5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynaQ5G5D5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynaQ5G5D5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynaQ5G5D5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SynaQ5G5D5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SynaQ5G5D5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SynaQ5G5D5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynaQ5G5D5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SynaQ5G5D5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynaQ5G5D5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SynaQ5G5D5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynaQ5G5D5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SynaQ5G5D5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SynaQ5G5D5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SynaQ5G5D5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynaQ5G5D5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SynaQ5G5D5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SynaQ5G5D5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynaQ5G5D5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynaQ5G5D5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SynaQ5G5D5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SynaQ5G5D5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SynaQ5G5D5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SynaQ5G5D5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SynaQ5G5D5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SynaQ5G5D5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynaQ5G5D5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynaQ5G5D5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SynaQ5G5D5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynaQ5G5D5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynaQ5G5D5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynaQ5G5D5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SynaQ5G5D5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynaQ5G5D5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynaQ5G5D5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SynaQ5G5D5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SynaQ5G5D5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SynaQ5G5D5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SynaQ5G5D5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SynaQ5G5D5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynaQ5G5D5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynaQ5G5D5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SynaQ5G5D5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SynaQ5G5D5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms