Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkaa1Q5EG47 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkaa1Q5EG47 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkaa1Q5EG47 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkaa1Q5EG47 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkaa1Q5EG47 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkaa1Q5EG47 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkaa1Q5EG47 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkaa1Q5EG47 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkaa1Q5EG47 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkaa1Q5EG47 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkaa1Q5EG47 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prkaa1Q5EG47 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prkaa1Q5EG47 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prkaa1Q5EG47 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkaa1Q5EG47 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkaa1Q5EG47 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkaa1Q5EG47 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkaa1Q5EG47 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkaa1Q5EG47 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkaa1Q5EG47 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkaa1Q5EG47 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkaa1Q5EG47 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkaa1Q5EG47 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkaa1Q5EG47 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkaa1Q5EG47 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkaa1Q5EG47 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkaa1Q5EG47 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkaa1Q5EG47 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prkaa1Q5EG47 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkaa1Q5EG47 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkaa1Q5EG47 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prkaa1Q5EG47 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkaa1Q5EG47 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms